聖若瑟大學校監為澳門教區主教。

主教：

1. 委任校長、副校長（們）及行政人員。
2. 與相關人士商議，對大學的標志及理念給予認可。
3. 主持所有在場的活動及儀式。

最初，聖若瑟大學校監為葡萄牙天主教大學的校監。但天主教大學校監兼任另一教區主教是十分罕見。因此，前兩任校監修改大學憲章並於2017年四月二十四日生效。

歷任校監:

• 2013/2017 – D. Manuel Clemente
• 1998/2013 – D. José Policarpo
• 1996/1998 – D. António Ribeiro